Linha 1 – Fármacos e Medicamentos
Esta linha visa estudar os aspectos relacionados à pesquisa e síntese, prospecção fitoquímica, estudos farmacológicos e toxicológicos de novos potenciais fármacos e outros insumos, bem como a pesquisa, desenvolvimento e controle de qualidade de novos medicamentos. Também se incluem nesta linha de pesquisa o desenvolvimento de formulações baseadas em nanotecnologia e de novos métodos analíticos e eletroanalíticos.
Linha 2 – Biociências, Saúde Pública e Assistência Farmacêutica
Esta linha inclui pesquisas relacionadas aos aspectos fisiopatológicos e epidemiológicos das doenças e seus agentes etiológicos, bem como projetos de pesquisa relacionados à Educação e Informação em Saúde. Também se incluem nesta linha de pesquisa os projetos que visam estudar a atuação do farmacêutico no contexto da Saúde Coletiva e a utilização de medicamentos e plantas medicinais pela população.