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O Núcleo de Geofísica Ambiental e Hidrogeologia realiza pesquisas sobre a ocorrência, o comportamento e a qualidade das águas subterrâneas, assim como também suas relações com as mudanças ambientais, visando propiciar a criação de instrumentos para a gestão dos recursos hídricos subterrâneos e melhor caracterização, aproveitamento e proteção dos aqüíferos das bacias hidrográficas em especial, as dos vales do Jequitinhonha e Mucuri.